Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ift88Q61371 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift88Q61371 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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