Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms