Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms