Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik1Q60934 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms