Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Slc6a4Q60857 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc6a4Q60857 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc6a4Q60857 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc6a4Q60857 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc6a4Q60857 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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