Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms