Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CttnQ60598 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CttnQ60598 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms