Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myh1Q5SX40 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms