Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tns3Q5SSZ5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Tns3Q5SSZ5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Tns3Q5SSZ5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tns3Q5SSZ5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms