Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mdc1Q5PSV9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mdc1Q5PSV9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms