Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms