Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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