Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms