Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1nQ497L1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms