Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms