Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms