Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b4Q3V0X2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms