Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms