Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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