Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chpf2Q3UU43 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms