Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms