Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms