Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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