Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms