Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd2Q3UGR5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd2Q3UGR5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms