Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms