Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms