Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms