Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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