Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccndbp1Q3TVC7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccndbp1Q3TVC7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccndbp1Q3TVC7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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