Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms