Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms