Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43aQ3TL54 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43aQ3TL54 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms