Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms