Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col24a1Q30D77 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms