Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms