Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms