Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms