Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms