Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms