Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms