Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MestQ07646 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MestQ07646 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MestQ07646 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MestQ07646 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MestQ07646 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MestQ07646 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MestQ07646 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MestQ07646 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
MestQ07646 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
MestQ07646 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MestQ07646 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MestQ07646 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MestQ07646 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms