Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms