Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms