Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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