Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms