Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sox9Q04887 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox9Q04887 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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