Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcr5Q04683 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms