Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms