Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crisp3Q03402 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms